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Artículo

Hierarchical Modular Structure Identification with Its Applications in Gene Coexpression NetworksIdentificación de la estructura jerárquica modular con sus aplicaciones en redes de coexpresión génica.

Resumen

La estructura del módulo de la red (comunidad) ha sido un tema de investigación candente en los últimos años. Se han propuesto muchos métodos para la detección e identificación de módulos. Se ha demostrado que la estructura jerárquica de los módulos existe en muchas redes, como las redes biológicas y las redes sociales. En comparación con los métodos de identificación de módulos particionales, se ha realizado menos investigación sobre la inferencia de la estructura modular jerárquica. En este artículo, proponemos un método para construir la estructura modular jerárquica basado en el modelo de bloques estocásticos. Se aplican pruebas estadísticas para probar las relaciones jerárquicas entre diferentes módulos. Presentamos tanto redes artificiales como ejemplos de datos reales para ilustrar el rendimiento de nuestro enfoque. La aplicación del método propuesto a la red de coexpresión génica de levadura muestra que tiene una estructura modular jerárquica con los módulos en diferentes niveles correspondientes a diferentes funciones génicas.

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