Resumen

El objetivo de esta investigación era identificar sistemáticamente y validar de forma preliminar la información de la etiqueta de secuencia expresada (EST) de Hevea brasiliensis utilizando la repetición de secuencia simple (SSR) y proporcionar pruebas para el desarrollo posterior del marcador molecular SSR. La definición de las características generales SSR de las secuencias de empalme EST de Hevea y el desarrollo de cebadores SSR sentaron las bases del análisis de la diversidad y la identificación de variedades para el recurso arbóreo de Hevea. Se identificaron 1134 loci SSR en la secuencia de empalme EST y se distribuyeron en 840 Unigene. La tasa de aparición de loci SSR fue del 23,9%, y la distancia media de distribución de EST-SSR fue de 2,59 kb. El principal tipo de repetición fue el motivo de repetición mononucleótido, que representó el 38,89%, mientras que el valor correspondiente fue de 36,95 para el motivo de repetición dinucleótido y de 18,17 para el motivo de repetición trinucleótido; la proporción de otros motivos fue sólo del 5,99%. Los motivos de repetición superiores para mononucleótidos, dinucleótidos y trinucleótidos fueron A/T, AG/CT y AAG/CTT, respectivamente. Se diseñaron 739 pares de cebadores para 1134 loci SSR. La amplificación por PCR se realizó en Hevea Reyan5-11, Reyan87-6-47 y PR107, y se seleccionaron 180 pares de cebadores capaces de amplificar bandas de polimorfismo.

• Materias:Ácido desoxirribonucleico (ADN) Ácido ribonucleico (ARN) Pliegue de Proteína Ácidos nucleicos Código genético
• Subjects:Deoxyribonucleic acid (DNA) Ribonucleic acid (RNA) Protein Folding Nucleic acids Genetic code
• Palabras claves:ssr loci, ssr, hevea est splicing sequences, est splicing sequence, hevea tree resource, simple sequence repeat, average distribution distance, dinucleotide repeat motif, general ssr features, major repeat type
• Keywords:ssr loci, ssr, hevea est splicing sequences, est splicing sequence, hevea tree resource, simple sequence repeat, average distribution distance, dinucleotide repeat motif, general ssr features, major repeat type