Resumen

Las proteínas de la familia del citocromo B5 (CB5) desempeñan un papel importante en diversas reacciones de oxidación/reducción en las células como donante de electrones y están implicadas en diversos procesos de estrés biótico y abiótico. Sin embargo, la función de las CB5 en Brassica rapa aún no está clara. En este estudio, llevamos a cabo la identificación, caracterización y análisis de expresión de BrCB5s en todo el genoma en diferentes tejidos sometidos a adversidades y estrés. Se identificaron quince BrCB5s distribuidos en diferentes cromosomas, que se clasificaron en siete grupos (A-G) según su relación filogenética. El análisis filogenético de las secuencias de proteínas CB5 de seis especies mostró que las BrCB5s llevan a cabo un proceso evolutivo cercano con las CB5s de Arabidopsis thaliana y lejano de las de Oryza sativa. El análisis de interacción de proteínas mostró que se predijeron 40 patrones de interacción, incluidas dos proteínas de la subfamilia del transportador de sacarosa 4 (SUT 4) y la proteína hidroxilasa de ácidos grasos 2 (FAH 2), que pueden interactuar con la mayoría de los miembros de BrCB5s. El análisis del perfil de expresión indicó que las BrCB5s se expresaban diferencialmente en distintos tejidos, y las abundancias de transcripción eran significativamente diferentes bajo diversos estreses abióticos y tratamientos hormonales de la planta. Nuestro estudio proporciona una base para una mejor comprensión de las características y funciones biológicas de los genes de la familia CB5 en la col china durante el desarrollo de la planta, especialmente en las respuestas de la planta a múltiples estreses.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:BrCB5s, diferentes tejidos, genes de la familia CB5, secuencias de proteínas CB5, Ácido Graso Hidroxilasa, Análisis de interacción de proteínas, procesos de estrés abiótico, proceso evolutivo cercano, análisis de perfiles de expresión, tratamientos hormonales de plantas.
• Keywords:BrCB5s, different tissues, CB5 family genes, CB5 protein sequences, Fatty Acid Hydroxylase, Protein interaction analysis, abiotic stress processes, close evolutionary process, expression profile analysis, plant hormone treatments