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Genome-Wide Identification and Analysis of Variants in Domestic and Wild Bactrian Camels Using Whole-Genome Sequencing DataIdentificación y análisis de variantes genómicas en camellos bactrianos domésticos y salvajes mediante secuenciación del genoma completo

Resumen

El tamaño de la población de camellos bactrianos es menor que el de los dromedarios, y se distribuyen en regiones frías y montañosas, además de estar en peligro de extinción en algunos países como Irán. Para identificar e investigar las variaciones en todo el genoma, se realizó por primera vez la secuenciación del genoma completo de dos camellos bactrianos iraníes con una cobertura de 37,4 y 42,6 veces. Junto con los camellos bactrianos iraníes, se volvieron a analizar los datos de secuenciación de dos camellos bactrianos domésticos mongoles y dos camellos bactrianos salvajes depositados en el NCBI. El análisis condujo a la identificación de 4.908.998, 4.485.725 y 4.706.654 SNP para los camellos bactrianos iraníes, mongoles domésticos y salvajes, respectivamente. Asimismo, las variaciones INDEL oscilaron entre 358.311 y 533.188 en los seis camellos. Los resultados de la anotación de variantes en todas las muestras revelaron que más del 88% de los SNP e INDEL se localizaban en las regiones intergénica e intrónica. Encontramos que 800.530 SNPs eran comunes entre todos los camellos estudiados, conteniendo 4.046 variantes missense que afectaban a 2.428 genes. La investigación de los genes comunes entre todos los camellos que contenían los SNPs sin sentido mostró que hay 98 genes zinc finger y 4 genes relacionados con la fertilidad (ZP1, ZP2, ZP4 y ZPBP) en este conjunto.

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