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Genome-Wide Identification and Analysis of the Chicken Basic Helix-Loop-Helix FactorsIdentificación y análisis genómicos de los factores básicos de hélice-bucle-hélice del pollo

Resumen

Los miembros de la familia de factores de transcripción bHLH (basic helix-loop-helix) desempeñan funciones importantes en una amplia gama de procesos de desarrollo. En este estudio, realizamos un estudio de todo el genoma utilizando la base de datos genómica del pollo (Gallus gallus) e identificamos 104 secuencias bHLH pertenecientes a 42 familias de genes en un esfuerzo por caracterizar la familia de factores de transcripción bHLH del pollo. Los análisis filogenéticos revelaron que el pollo tiene 50, 21, 15, 4, 8 y 3 miembros bHLH en los grupos A, B, C, D, E y F, respectivamente, mientras que tres miembros que no pertenecen a ninguno de estos grupos se clasificaron como ''huérfanos''. Una comparación entre los repertorios bHLH del pollo y del ser humano sugirió que ambos organismos tienen un número de miembros bHLH específicos de linaje en los proteomas. Los patrones de distribución cromosómica y los análisis filogenéticos sugieren claramente que los miembros bHLH deberían haber surgido por duplicación génica en una fecha temprana. Las estadísticas de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) mostraron 51 anotaciones GO principales de procesos biológicos contados en la frecuencia. El presente estudio profundiza nuestro conocimiento de la familia de factores de transcripción bHLH del pollo y proporciona mucha información útil para futuros estudios utilizando el pollo como sistema modelo.

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