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Las etiquetas de secuencia expresada (EST) son una fuente potencial para el desarrollo de marcadores de microsatélites genéticos, el descubrimiento de genes, la genómica comparativa y otros estudios genómicos. En el presente estudio se examinaron 7630 EST del NCBI para la identificación y caracterización de SSR. Se identificaron un total de 263 SSR con una densidad media de un SSR/4,2 kb (3,4 de frecuencia). El análisis reveló que las repeticiones trinucleotídicas (47,52%) eran las más abundantes, seguidas de las tetranucleotídicas (19,77%), dinucleotídicas (19,01%), pentanucleotídicas (9,12%) y hexanucleotídicas (4,56%). La anotación funcional se realizó mediante búsqueda de homología y ontología génica, y se seleccionaron 35 EST-SSR. Se diseñaron pares de cebadores para evaluar la transferibilidad cruzada y el polimorfismo entre 11 plantas pertenecientes a cinco familias diferentes. Se generó un total de 402 alelos en 155 loci, con una media de 2,6 alelos/locus, y el contenido de información polimórfica (PIC) osciló entre 0,15 y 0,92, con una media de 0,75. La transferibilidad cruzada osciló entre 34 y 40 alelos por loci. La transferibilidad cruzada osciló entre el 34,84% y el 98,06% en diferentes plantas, con una media del 67,86%. Así pues, el estudio de validación de 35 marcadores EST-SSR anotados que corresponden a una actividad metabólica particular reveló polimorfismo y naturaleza evolutiva en diferentes familias de plantas angiospermas.
Esta es una versión de prueba de citación de documentos de la Biblioteca Virtual Pro. Puede contener errores. Lo invitamos a consultar los manuales de citación de las respectivas fuentes.
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