Resumen

Las etiquetas de secuencia expresada (EST) son una fuente potencial para el desarrollo de marcadores de microsatélites genéticos, el descubrimiento de genes, la genómica comparativa y otros estudios genómicos. En el presente estudio se examinaron 7630 EST del NCBI para la identificación y caracterización de SSR. Se identificaron un total de 263 SSR con una densidad media de un SSR/4,2 kb (3,4 de frecuencia). El análisis reveló que las repeticiones trinucleotídicas (47,52%) eran las más abundantes, seguidas de las tetranucleotídicas (19,77%), dinucleotídicas (19,01%), pentanucleotídicas (9,12%) y hexanucleotídicas (4,56%). La anotación funcional se realizó mediante búsqueda de homología y ontología génica, y se seleccionaron 35 EST-SSR. Se diseñaron pares de cebadores para evaluar la transferibilidad cruzada y el polimorfismo entre 11 plantas pertenecientes a cinco familias diferentes. Se generó un total de 402 alelos en 155 loci, con una media de 2,6 alelos/locus, y el contenido de información polimórfica (PIC) osciló entre 0,15 y 0,92, con una media de 0,75. La transferibilidad cruzada osciló entre 34 y 40 alelos por loci. La transferibilidad cruzada osciló entre el 34,84% y el 98,06% en diferentes plantas, con una media del 67,86%. Así pues, el estudio de validación de 35 marcadores EST-SSR anotados que corresponden a una actividad metabólica particular reveló polimorfismo y naturaleza evolutiva en diferentes familias de plantas angiospermas.

• Materias:Genes Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Genes Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Genetic polymorphism
• Palabras claves:EST, promedio, transferibilidad cruzada, familias diferentes, marcadores microsatélites genéticos, otros estudios genómicos, actividad metabólica particular, contenido de información polimórfica, SSR, alelos
• Keywords:EST, average, cross transferability, different families, genic microsatellite markers, other genomic studies, particular metabolic activity, polymorphic information content, SSRs, alleles