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Genome-Wide Identification and Characterization of the LRR-RLK Gene Family in Two Vernicia SpeciesIdentificación y caracterización genómica de la familia de genes LRR-RLK en dos especies de Vernicia

Resumen

Las quinasas similares a receptores con repeticiones ricas en leucina (LRR-RLK) constituyen el mayor grupo de RLK en plantas y desempeñan papeles importantes en muchos procesos biológicos clave, como la respuesta a patógenos y la transducción de señales. Hasta la fecha, la mayoría de los estudios sobre LRR-RLKs se han realizado en plantas modelo. Aquí, identificamos 236 y 230 LRR-RLKs en dos árboles industriales productores de aceite: Vernicia fordii y Vernicia montana, respectivamente. Los análisis de alineación de secuencias mostraron que la homología del dominio RLK (23,81%) era mayor que la del dominio LRR (9,51%) entre las Vf/VmLRR-RLKs. El motivo conservado del dominio LRR en Vf/VmLRR-RLKs coincidía bien con la secuencia consenso LRR conocida de plantas, pero difería en el antepenúltimo aminoácido (W o L). El análisis filogenético reveló que las Vf/VmLRR-RLKs se agrupaban en 16 subclados. Se caracterizaron los perfiles de expresión de las Vf/VmLRR-RLK en varios tipos de tejidos, como la raíz, la hoja, el pétalo y la semilla. Investigaciones posteriores revelaron que los genes ortólogos Vf/VmLRR-RLK mostraban principalmente patrones de expresión similares en respuesta a la enfermedad del marchitamiento del árbol, excepto 4 pares de Vf/VmLRR-RLKs que mostraban tendencias de expresión opuestas. Estos resultados representan una amplia evaluación de las LRR-RLK en dos árboles oleaginosos industriales y serán útiles para futuros estudios funcionales sobre estas proteínas.

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