Resumen

Antecedentes. El carcinoma papilar de tiroides (CPT) es una neoplasia endocrina maligna frecuente, y su incidencia aumenta continuamente en todo el mundo en los últimos años. Sin embargo, los biomarcadores clínicos eficientes siguen siendo deficientes; la presente investigación tiene como objetivo explorar los genes centrales significativos del PTC. Métodos. Integramos tres cohortes para identificar genes centrales y vías asociadas al PTC mediante un exhaustivo análisis bioinformático. Se incluyeron en esta investigación los perfiles de expresión GSE33630, GSE35570 y GSE60542, que incluían 114 tejidos de PTC y 126 tejidos normales. Se utilizaron análisis de ontología génica (GO) y de enriquecimiento de vías de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto (KEGG) para buscar los comportamientos biológicos cruciales y las vías implicadas en la carcinogénesis del PTC. Se construyó una red de interacción proteína-proteína (PPI) y se estudiaron en profundidad los módulos significativos. Resultados. Se descubrió un total de 831 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales 410 estaban regulados al alza y 421 a la baja en los tejidos del PTC en comparación con los tejidos tiroideos normales. El análisis de la red PPI demostró las interacciones entre estos DEG, y los 10 genes principales (TGFB1, CXCL8, LRRK2, CD44, CCND1, JUN, DCN, BCL2, ACACB y CXCL12) con el mayor grado de conectividad se extrajeron de la red y se verificaron mediante el conjunto de datos TCGA y el experimento RT-PCR de las muestras de PTC. Cuatro de los genes centrales (CXCL8, DCN, BCL2 y ACACB) se relacionaron con el pronóstico de los pacientes con PTC y se consideraron genes centrales clínicamente relevantes a través del análisis de supervivencia. Conclusiones. En conclusión, proponemos una serie de genes clave asociados al desarrollo del PTC y estos genes podrían servir como biomarcadores diagnósticos o dianas terapéuticas en el futuro tratamiento del PTC.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:PTC, genes, tejidos PTC, genes hub, perfiles de expresión GSE33630, análisis de redes PPI, carcinoma papilar de tiroides, análisis bioinformático exhaustivo, comportamientos biológicos cruciales, biomarcadores clínicos eficientes.
• Keywords:PTC, genes, PTC tissues, hub genes, Expression profiles GSE33630, PPI network analysis, Papillary thyroid carcinoma, comprehensive bioinformatics analysis, crucial biological behaviors, efficient clinical biomarkers