La subestructura de la población es un factor de confusión bien conocido en los estudios genéticos de casos y controles basados en la población, pero su impacto en los estudios basados en la familia no está claro. Hemos realizado un análisis de la subestructura de la población utilizando familias extensas de población mixta para evaluar la potencia y el error de tipo I en el marco de un estudio de asociación. Nuestro análisis muestra que la potencia mejoró en un 1,5
tras el ajuste de componentes principales. El error de tipo I también se redujo en un 2,2
tras ajustar la subestratificación familiar. La presencia de subestructura poblacional se puso de manifiesto en el análisis discriminante, en el que más del 92% de los individuos fueron asignados correctamente a su familia real utilizando sólo 100 componentes principales. Este estudio demuestra la importancia de tener en cuenta la subestructura de la población en los estudios familiares de poblaciones mezcladas.
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