Se analizó la biomasa granular de un ensayo de biorreactor anaeróbico a escala de laboratorio para identificar los cambios en la estructura y función de la comunidad microbiana en respuesta a la temperatura y al tricloroetileno (TCE). Dos biorreactores funcionaron a 37°C, mientras que otros dos lo hicieron a 15°C. En el momento del muestreo, uno de cada par de biorreactores de temperatura fue expuesto a concentraciones de TCE (60 mg L-1) que inducían al fracaso del proceso, mientras que el otro sirvió de control sin TCE. La estructura de la comunidad bacteriana se investigó mediante electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante (DGGE) y análisis de bibliotecas de clones del gen 16S rRNA. La temperatura se identificó como un factor importante para la composición de la comunidad bacteriana, mientras que las diferencias menores se asociaron con la suplementación de tricloroetileno. Las proteobacterias fueron el filo dominante en todos los biorreactores, mientras que el análisis de la biblioteca de clones reveló una mayor proporción de clones del tipo Bacteroidetes, Chloroflexi y Firmicutes a 15°C que a 37°C. La metaproteómica comparativa en presencia y ausencia de TCE se llevó a cabo mediante electroforesis bidimensional en gel (2-DGE), y se identificaron 28 manchas de proteínas, con funciones putativas relacionadas con procesos celulares, incluyendo la metanogénesis, la glucólisis, el ciclo del glioxilato y la vía del metilmalonilo. Se observó una buena concordancia entre la asignación de especies metaproteómicas y la información filogenética, con 10 de las proteínas identificadas asociadas a miembros del phylum Proteobacteria.
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