Resumen

Los ensayos de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) dirigidos a los genes 16S rRNA seguidos de secuenciación del ADN siguen siendo herramientas importantes para caracterizar las comunidades microbianas presentes en muestras ambientales. Sin embargo, a pesar del creciente número de secuencias de ADN de arqueas depositadas en bases de datos, hasta ahora no tenemos una imagen clara de la eficacia y especificidad de los cebadores universales ampliamente utilizados para describir comunidades de arqueas de diferentes hábitats naturales. Por lo tanto, en este estudio, comparamos el perfil filogenético obtenido cuando muestras de ADN de sedimentos lacustres de Cerrado fueron sometidas a PCR 16S rDNA empleando tres conjuntos de cebadores específicos de Archaea comúnmente utilizados. Nuestros resultados revelan que la especificidad de los cebadores difirió dependiendo de la fuente del ADN analizado. Además, las comunidades de arqueas reveladas por cada par de cebadores variaron enormemente, lo que indica que la elección del cebador del gen 16S rRNA afecta al perfil de comunidad obtenido, con diferencias tanto en la detección de taxones como en las estimaciones de unidades taxonómicas operativas (OTU).

• Materias:Acetamida
• Subjects:Acetamida
• Palabras claves:Arqueas; PCR; Cebadores universales; Microbiología ambiental
• Keywords:Archaea; PCR; Universal primers; Environmental microbiology