Resumen

En este estudio teórico, se analiza el papel de la fracción de cadena lateral del residuo C-terminal en la influencia de las propiedades estructurales y moleculares de los dipéptidos, considerando una serie de siete dipéptidos. Las posiciones C-terminales de los dipéptidos se han variado con siete residuos de aminoácidos diferentes, a saber. Val, Leu, Asp, Ser, Gln, His y Pyl, mientras que sus posiciones N-terminales se mantienen constantes con residuos Sec. La optimización completa de la geometría y los cálculos de las frecuencias vibracionales se llevan a cabo en el nivel B3LYP/6-311 G(d,p) en fase gaseosa y acuosa. Se comprueba que los efectos estereoelectrónicos de los restos de cadena lateral de los residuos C-terminales influyen en los valores de los diedros Φ y Ω, en la planaridad de los planos del péptido y en la geometría alrededor de los átomos de carbono C7 α de los dipéptidos. Las combinaciones de enlaces H intramoleculares de los dipéptidos en fase gaseosa son similares a las de la fase acuosa. Los espectros vibracionales teóricos de los dipéptidos reflejan la naturaleza de los enlaces H intramoleculares existentes en las estructuras de los dipéptidos. Los efectos de solvación del medio acuoso son evidentes en los parámetros geométricos relacionados con los planos amídicos, los momentos dipolares, las brechas de energía HOMOLUMO, así como la estabilidad termodinámica de los dipéptidos.

• Materias:Bioquímica Proteínas Ácidos grasos Enfermedades bacterianas Fosfolípidos
• Subjects:Biochemistry Proteins Acids fatty Bacterial diseases Phospholipid
• Palabras claves:dipéptidos, fracción de cadena lateral, fase acuosa, posición terminal, residuos terminales, espectro vibracional teórico, brecha de energía homolumo, optimización de la geometría completa, residuos de aminoácidos, propiedades de los dipéptidos
• Keywords:dipeptides, side chain moiety, aqueous phase, terminal position, terminal residues, theoretical vibrational spectrum, homolumo energy gap, full geometry optimization, amino acid residues, property of dipeptides