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Artículo

Interactome of Radiation-Induced microRNA-Predicted Target GenesInteractoma de genes diana de microARN inducidos por radiación

Resumen

Los microARN (miARN) funcionan como reguladores negativos globales de la expresión génica y se han asociado a multitud de procesos biológicos. La disfunción del microARNoma se ha relacionado con diversas enfermedades, entre ellas el cáncer. Nuestro laboratorio ha informado recientemente de la modulación de la expresión de miARN en diversos tipos celulares expuestos a radiación ionizante (RI). Para comprender mejor el papel de los miARN en las vías de estrés inducidas por la IR, catalogamos un conjunto de miARN comunes modulados en varias líneas celulares irradiadas y generamos una lista de genes diana previstos. Utilizando herramientas bioinformáticas avanzadas, identificamos las vías celulares en las que funcionan los genes diana predichos por miARN. Se descubrió que los genes diana de miARN desempeñaban papeles clave en vías de estrés por IR previamente identificadas, como el ciclo celular, la vía p53, la vía TGF-beta, la proteólisis mediada por ubiquitina, la vía de adhesión focal, la señalización MAPK, la vía del cáncer de tiroides, la unión adherente, la vía de señalización de la insulina, la meiosis de oocitos, la regulación del citoesqueleto de actina y la vía del carcinoma de células renales. Curiosamente, hemos podido identificar nuevas vías que no se habían identificado en la respuesta celular a la radiación, como la reabsorción de sodio regulada por la aldosterona, la potenciación a largo plazo y las vías de señalización de los neutrófilos. Nuestro análisis indica que el interactoma de miARN en células irradiadas proporciona una plataforma para el modelado exhaustivo de la respuesta celular al estrés por exposición a IR.

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