La trombina desempeña un papel vital en la coagulación sanguínea, que es un proceso clave implicado en la trombosis al promover la agregación plaquetaria y convertir el fibrinógeno para formar el coágulo de fibrina. Según el concepto de receptor, los fármacos producen sus efectos terapéuticos mediante interacciones con las dianas. Por lo tanto, la investigación de la interacción entre la trombina y las moléculas pequeñas es importante para descubrir el potencial inhibidor de la trombina. En este estudio, se desarrollaron métodos de electroforesis capilar de afinidad (ACE) y de acoplamiento molecular in silico para estudiar la interacción entre la trombina y diez compuestos fenólicos (ácido p-hidroxibenzoico, ácido protocatechuico, ácido vanílico, ácido gálico, catequina, epicatequina, dihidroquercetina, naringenina, apigenina y baicaleína). Los resultados de la ECA mostraron que los ácidos gálicos y seis compuestos flavonoides tenían interacciones relativamente fuertes con la trombina. Además, los resultados del acoplamiento indicaron que todas las conformaciones óptimas de los seis compuestos flavonoides se situaban en el centro de actividad de la trombina y tenían interacción con el HIS57 o SER195, que era el residuo clave para unir inhibidores de la trombina como el argatroban. En este sentido, estos seis compuestos flavonoides podrían tener el potencial de la actividad de inhibición de la trombina. Además, el método desarrollado en este estudio puede aplicarse para estudiar las interacciones de otras moléculas con la trombina.
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