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Artículo

Coexpression within Integrated Mitochondrial Pathways Reveals Different Networks in Normal and Chemically Treated TranscriptomesLa coexpresión en vías mitocondriales integradas revela redes diferentes en transcriptomas normales y tratados químicamente

Resumen

Como productoras de energía, las mitocondrias desempeñan un papel fundamental en múltiples procesos celulares. Aunque varias líneas de evidencia sugieren que la expresión diferencial de los complejos respiratorios mitocondriales (MRCs) tiene un impacto significativo en la función mitocondrial, el papel de los MRCs integrados en toda la red de coexpresión aún no se ha revelado. En este estudio, construimos redes de coexpresión basadas en conjuntos de datos de microarrays de diferentes tejidos y tratamientos químicos para explorar el papel de los MRC integrados en la red de coexpresión y los efectos de diferentes sustancias químicas en la red mitocondrial. Al agrupar las MRC como una diana semilla, la distribución hipergeométrica nos permitió identificar los genes que se coexpresan significativamente con las MRC integradas. La coexpresión entre 46 genes MRC (aproximadamente el 78% de los genes MRC analizados) fue significativa en el conjunto de datos del transcriptoma del tejido normal. Estos genes MRC se coexpresan con genes implicados en las categorías "proceso del sistema muscular", "proceso metabólico" y "vías de enfermedades neurodegenerativas", mientras que, en los tejidos tratados químicamente, la coexpresión de estos genes desapareció en su mayor parte. Estos resultados indican que los estímulos químicos alteran la red de coexpresión normal de los genes MRC. En conjunto, los conjuntos de datos obtenidos a partir de las diferentes redes de coexpresión son informativos sobre la biogénesis mitocondrial y deberían contribuir a comprender los efectos secundarios de los fármacos sobre la función mitocondrial.

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Información del documento

  • Titulo:Coexpression within Integrated Mitochondrial Pathways Reveals Different Networks in Normal and Chemically Treated Transcriptomes
  • Autor:Cong, Chen; Tae Kyung, Hyun; Xiao, Han; Zhihui, Feng; Yuan, Li; Xiaolong, Liu; Jiankang, Liu
  • Tipo:Artículo
  • Año:2014
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Genes Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Polimorfismo genético
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