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Divergence of the bZIP Gene Family in Strawberry, Peach, and Apple Suggests Multiple Modes of Gene Evolution after DuplicationLa divergencia de la familia de genes bZIP en fresa, melocotón y manzana sugiere múltiples modos de evolución génica tras la duplicación

Resumen

Los factores de transcripción de cremallera básica de leucina (bZIP) son los miembros más diversos de los factores de transcripción dimerizantes. En el presente estudio se identificaron 50, 116 y 47 genes bZIP en Malus domestica (manzana), Prunus persica (melocotón) y Fragaria vesca (fresa), respectivamente. La duplicación específica de cada especie fue el principal factor que contribuyó al gran número de bZIP observado en el manzano. Tras el WGD en el genoma de la manzana, se conservaron los genes bZIP ortólogos correspondientes a la fresa en las regiones duplicadas del genoma de la manzana. Sin embargo, en el ancestro del melocotón, estas regiones sinténicas se perdieron o eliminaron rápidamente. Quizá la selección positiva contribuyó a la expansión del clado S para adaptarse al desarrollo y a las tensiones del entorno. Además, la selección purificadora fue la principal responsable de la unión al ADN específica de la secuencia bZIP. El análisis de pares ortólogos entre cromosomas indica que estos ortólogos derivan de una duplicación génica localizada en uno de los nueve cromosomas antiguos de las Rosáceas. El análisis comparativo de los genes bZIP en tres especies proporciona información sobre el destino evolutivo de los genes bZIP en el manzano y el melocotonero tras divergir de la fresa.

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