Resumen

Los factores de respuesta a auxinas (ARFs) juegan un papel crucial en la respuesta mediada por auxinas, mientras que la genética molecular de los genes ARFs ha sido raramente investigada en Setaria italica, un importante cultivo y planta modelo C4. En el presente estudio, se realizó un análisis evolutivo del genoma completo de los ARFs en S. italica. Se identificaron 24 genes SiARF distribuidos de forma desigual en ocho de los nueve cromosomas de S. italica. La exploración del modo de duplicación implicó que 13 proteínas SiARF se originaron a partir de la duplicación de todo el genoma y sufrieron selección purificadora. La reconstrucción de la filogenia de las SiARF mediante árboles de máxima verosimilitud y de unión de vecinos reveló que las SiARF podían dividirse en cuatro clados. Los SiARF agrupados en el mismo clado compartían una estructura génica y una composición de dominios proteicos similares, lo que implicaba redundancia funcional. Además, la composición aminoacídica de las regiones medias se conservaba en los SiARF pertenecientes al mismo clado. Los SiARF se clasificaron en activadores o represores según el enriquecimiento de aminoácidos específicos. El desorden intrínseco aparecía en las regiones medias de los activadores ARF. Por último, los perfiles de expresión de SiARFs bajo tratamiento hormonal y estrés abiótico no sólo revelaron su función potencial en la respuesta al estrés, sino que también indican su redundancia funcional. En general, nuestros resultados permiten comprender mejor los aspectos evolutivos de los SiARF y contribuyen a su caracterización funcional.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genoma Genética vegetal Proteómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis genome Plant genetics Proteomics
• Palabras claves:SiARFs, S. italica, redundancia funcional, regiones medias, mismo clado, factores de respuesta a la auxina, planta modelo C4, exploración del modo de duplicación, tratamiento de estrés abiótico, composición de aminoácidos.
• Keywords:SiARFs, S. italica, functional redundancy, middle regions, same clade, Auxin response factors, C4 model plant, Duplication mode exploration, abiotic stress treatment, amino acid composition