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Comparative Genomics of Actinobacillus pleuropneumoniae Serotype 8 Reveals the Importance of Prophages in the Genetic Variability of the SpeciesLa genómica comparativa de Actinobacillus pleuropneumoniae serotipo 8 revela la importancia de los profagos en la variabilidad genética de la especie

Resumen

Actinobacillus pleuropneumoniae es el agente etiológico de la pleuroneumonía porcina. En la actualidad, existen 18 serotipos diferentes; el serotipo 8 es el más ampliamente distribuido en Estados Unidos, Canadá, Reino Unido y el sureste de Brasil. En este estudio, se compararon los genomas de siete aislados clínicos del serotipo 8 de A. pleuropneumoniae con los demás genomas de doce serotipos. Los análisis de los genomas del serotipo 8 dieron como resultado un conjunto de 2352 secuencias codificadoras de proteínas. De estas secuencias, 76,6 están presentes en todos los serotipos, 18,5 serotipos, el 18,5% se comparte con algunos serotipos y el 4,9% es diferencial. Esta porción diferencial se caracterizó como una serie de secuencias proteicas hipotéticas y reguladoras: secuencia de elementos móviles. El análisis de la sintenia demostró posibles eventos de recombinación génica y adquisición por transferencia horizontal de genes (HGT) en esta especie. Se identificaron en los genomas un total de 30 secuencias relacionadas con profagos. Estas secuencias representaban entre el 0,3 y el 3,5% del genoma de las cepas analizadas, y 16 de ellas contenían profagos completos. El análisis de similitud entre secuencias completas de profagos evidenció un posible HGT con especies pertenecientes a la familia Pasteurellaceae. Así pues, los elementos genéticos móviles, como los profagos, son componentes importantes de la porción diferencial del genoma de A. pleuropneumoniae y demuestran un papel central en la evolución de la especie. Este estudio representa el primero realizado para conocer el genoma de A. pleuropneumoniae serotipo 8.

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Información del documento

  • Titulo:Comparative Genomics of Actinobacillus pleuropneumoniae Serotype 8 Reveals the Importance of Prophages in the Genetic Variability of the Species
  • Autor:Isabelle Gonçalves de Oliveira, Prado; Giarlã Cunha, da Silva; Josicelli Souza, Crispim; Pedro Marcus Pereira, Vidigal; Moysés, Nascimento; Mateus Ferreira, Santana; Denise Mara Soares, Bazzolli
  • Tipo:Artículo
  • Año:2020
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
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