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Transcriptome-Based Modeling Reveals that Oxidative Stress Induces Modulation of the AtfA-Dependent Signaling Networks in Aspergillus nidulansLa modelización basada en el transcriptoma revela que el estrés oxidativo induce la modulación de las redes de señalización dependientes de AtfA en Aspergillus nidulans

Resumen

Para comprender mejor las funciones moleculares del regulador maestro de la respuesta al estrés AtfA en Aspergillus nidulans, se realizaron análisis transcriptómicos del mutante nulo atfA y de las cepas de control apropiadas expuestas a estrés oxidativo inducido por menadiona bisulfito sódico (MSB), t-butilhidroperóxido y diamida. Varios elementos de la respuesta al estrés oxidativo se expresaron de forma diferencial. Muchos de ellos, incluida la regulación a la baja del ciclo celular mitótico, como la regulación al alza específica del estrés por MSB del ensamblaje de grupos de FeS y la regulación a la baja específica del estrés por MSB de la reducción de nitratos, el ciclo del ácido tricarboxílico y el transporte mediado por vesículas de ER a Golgi, mostraron dependencia de AtfA. Para dilucidar el posible papel regulador global de AtfA que rige la expresión de un elevado número de genes con funciones biológicas muy versátiles, ideamos un modelo basado en los exhaustivos datos transcriptómicos. Nuestro modelo sugiere que una función importante de AtfA es modular la transducción de señales de estrés. Aunque puede regular directamente sólo un número limitado de genes, éstos incluyen elementos de la red de señalización, por ejemplo, miembros de los sistemas de transducción de señales de dos componentes. AtfA actúa de manera específica frente al estrés, lo que puede aumentar aún más el número y la diversidad de genes dependientes de AtfA. Nuestro modelo arroja luz sobre la versatilidad de las funciones fisiológicas de AtfA y sus ortólogos en hongos.

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Información del documento

  • Titulo:Transcriptome-Based Modeling Reveals that Oxidative Stress Induces Modulation of the AtfA-Dependent Signaling Networks in Aspergillus nidulans
  • Autor:Erzsébet, Orosz; Károly, Antal; Zoltán, Gazdag; Zsuzsa, Szabó; Kap-Hoon, Han; Jae-Hyuk, Yu; István, Pócsi; Tamás, Emri
  • Tipo:Artículo
  • Año:2017
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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