Resumen

Actualmente se están recopilando sistemáticamente décadas de datos bioquímicos, bioinformáticos y de secuenciación en reconstrucciones metabólicas a escala del genoma (GEM). Estas reconstrucciones son bases de conocimiento útiles para la ingeniería, el modelado y el análisis comparativo. Aquí revisamos las quince GEM de especies arqueas que se han construido hasta la fecha. Representan principalmente a miembros de la Euryarchaeota, con tres cuartas partes de representantes de metanógenos. A diferencia de otras revisiones sobre los GEM, nos centramos especialmente en las arqueas. Revisamos brevemente el proceso de construcción de los GEM y la genealogía de los modelos arqueos. A continuación, se revisan los principales conocimientos obtenidos durante la construcción de estos modelos, centrándose específicamente en las nuevas predicciones de las vías metabólicas y las características de crecimiento. El uso de las vías metabólicas se discute en el contexto de la composición de la biomasa de cada organismo y de sus necesidades específicas de energía y crecimiento. Mostramos cómo los modelos metabólicos pueden utilizarse para estudiar la evolución del metabolismo en las arqueas. La conservación de determinadas vías metabólicas puede estudiarse comparando las reacciones mediante los genes asociados a sus enzimas. Esto demuestra la utilidad de los GEMs para los estudios evolutivos, mucho más allá de su propósito original de modelización metabólica; sin embargo, queda mucho por hacer antes de que los modelos de las arqueas sean tan extensamente completos como los de las bacterias.

• Materias:Dióxido de carbono Genes Metabolismo (Bioquimica) Arqueas metanogénico
• Subjects:Carbon dioxide Genes Metabolism (Biochemistry) Archeas methanogenic
• Palabras claves:modelo de arquea, vía metabólica particular, predicción de la vía metabólica, gema de arquea, representante de metanógeno, uso de la vía metabólica, trimestre que comprende el representante, evolución del metabolismo, utilidades de la gema, proceso de construcción de la gema
• Keywords:archaeal model, particular metabolic pathway, metabolic pathway prediction, gem of archaeal, representative of methanogen, metabolic pathway usage, quarter comprising representative, evolution of metabolism, utilities of gem, gem construction process