Resumen

Es vital desentrañar el sesgo en el uso de codones para comprender mejor las fuerzas evolutivas que dictan el proceso de evolución viral. El virus de la gripe A ha atraído la atención de muchos investigadores a lo largo de los años debido a su elevada tasa de mutación y al hecho de que en el genoma vírico se produzcan cambios transversales específicos. Varios autores han señalado que el sesgo en el uso de codones es bajo en los virus de la gripe A, citando la presión mutacional como la fuerza decisiva que configura el uso de codones en estos virus. En este estudio, se han explorado las secuencias codificantes completas de los genes de la hemaglutinina del subtipo H1N1 del virus de la gripe A en busca del posible sesgo en el uso de codones que actúa sobre estos genes. Los resultados indican un sesgo general bajo con valores de ENC máximos. El contenido de GC es sustancialmente bajo en comparación con el contenido de AT en los sitios de codones silenciosos. Se observaron correlaciones significativas entre los parámetros de composición y AT3, lo que implica el posible papel de este último en la formación del perfil de uso de codones en la hemaglutinina viral. Los datos mostraron claramente que las secuencias eran redundantes en A y que la mayoría de los codones preferían el nucleótido A a otros en el tercer codón sinónimo. Los resultados indicaron el papel fundamental de la presión composicional que afecta al uso de codones en este virus.

• Materias:Genes Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Genes Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Genetic polymorphism
• Palabras claves:sesgo de uso de codones, virus, uso de codones, posible sesgo de uso de codones, tercer sitio de codones sinónimos, perfil de uso de codones, alta tasa de mutación, sesgo global bajo, sitios de codones silenciosos, proceso de evolución viral
• Keywords:codon usage bias, virus, codon usage, possible codon usage bias, third synonymous codon site, codon usage profile, high mutation rate, overall low bias, silent codon sites, viral evolution process