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Insights into the Genome Sequence of Chromobacterium amazonense Isolated from a Tropical Freshwater LakeLa secuencia del genoma de Chromobacterium amazonense aislado de un lago tropical de agua dulce

Resumen

Los miembros del género Chromobacterium se han aislado de ecosistemas geográficamente diversos y presentan una considerable flexibilidad metabólica, así como propiedades biotecnológicas y patógenas en algunas especies. En este estudio se presenta el borrador del ensamblaje y el análisis detallado de la secuencia de la cepa 56AF de Chromobacterium amazonense. El genoma ensamblado de novo tiene un tamaño de 4.556.707 pb y contiene 4.294 genes codificadores de proteínas y 95 de ARN, incluidos 88 de ARNt, seis de ARNr y un operón de ARNtm. Está presente un repertorio de genes implicados en la virulencia, por ejemplo, hemolisina, enterotoxinas hemolíticas, colicina V, proteínas líticas e hidrolasas Nudix. El genoma también contiene una colección de genes de interés biotecnológico, como esterasas, lipasas, auxinasas, quitinasas, fitoeno sintasa y fitoeno desaturasa, polihidroxialcanoatos, violaceína, plastocianina/azurina y compuestos detoxificantes. Es importante destacar que, a diferencia de otras especies de Chromobacterium, el genoma de 56AF contiene genes para la toxina formadora de poros alfa-hemolisina, un sistema de secreción de tipo IV, entre otros. El análisis del genoma de la cepa 56AF de C. amazonense revela la versatilidad, adaptabilidad y potencial biotecnológico de esta bacteria. Este estudio proporciona información molecular que puede allanar el camino para futuros estudios genómicos comparativos y funcionales con aislados relacionados con Chromobacterium y mejora nuestra comprensión de la diversidad genómica global de las especies de Chromobacterium.

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Información del documento

  • Titulo:Insights into the Genome Sequence of Chromobacterium amazonense Isolated from a Tropical Freshwater Lake
  • Autor:Alexandre Bueno, Santos; Patrícia Silva, Costa; Anderson Oliveira, do Carmo; Gabriel, da Rocha Fernandes; Larissa Lopes Silva, Scholte; Jeronimo, Ruiz; Evanguedes, Kalapothakis; Edmar, Chartone-Souza; Andréa Maria Amaral, Nascimento
  • Tipo:Artículo
  • Año:2018
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
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