Resumen

Los microARN desempeñan un papel fundamental en la regulación de una amplia gama de procesos biológicos, actuando mediante la escisión de ARNm o la represión traslacional. Un grupo de microARN de plantas se conserva evolutivamente; sin embargo, otros se expresan de forma específica para cada especie. El yute es un cultivo de fibra agroeconómicamente importante; sin embargo, hasta la fecha no se dispone de información práctica sobre los microARN en el yute. En este estudio, la secuenciación Illumina reveló un total de 227 microRNAs conocidos y 17 posibles nuevos microRNAs candidatos en el yute, de los cuales 164 pertenecen a 23 familias conservadas y los 63 restantes pertenecen a 58 familias no conservadas. De un total de 81 familias de microARN identificadas, se predijeron 116 genes diana potenciales para 39 familias y 11 dianas para 4 de los 17 nuevos microARN identificados. Para comprender mejor las funciones de los microARN, los genes diana se analizaron mediante Gene Ontology y sus vías se ilustraron mediante análisis de vías KEGG. La presencia de los microRNAs identificados en el yute fue validada por RT-PCR de bucle de tallo seguida de PCR de punto final y qPCR para 20 microRNAs conocidos y nuevos seleccionados al azar. Este estudio identifica exhaustivamente los microARN y sus genes diana en el yute, lo que en última instancia allanará el camino para comprender su papel en este cultivo y en otros.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:microRNAs, yute, nuevos microRNAs, genes diana, análisis de vías KEGG, PCR de punto final, importante cultivo fibroso, genes diana potenciales, familias, estudio
• Keywords:microRNAs, jute, novel microRNAs, target genes, KEGG pathway analyses, end point PCR, important fibre crop, potential target genes, families, study