Resumen

Bdellovibrio spp. son bacterias depredadoras con gran potencial como agentes antimicrobianos. Los estudios han demostrado que los miembros del género Bdellovibrio presentan características peculiares que influyen en sus adaptaciones ecológicas. En este estudio se secuenciaron los genomas completos de dos Bdellovibrio spp. diferentes, designadas SKB1291214 y SSB218315, aisladas del suelo. Los genes centrales compartidos por todas las Bdellovibrio spp. consideradas para el análisis del pangenoma, incluida la epibiótica B. exovorus, fueron 795. El número de genes únicos identificados en Bdellovibrio spp. SKB1291214, SSB218315, W y B. exovorus JJS fue de 1343, 113, 857 y 1572, respectivamente. Estos genes únicos codifican proteínas hidrolíticas, quimiotaxis y transportadoras que podrían ser útiles para la depredación en las cepas de Bdellovibrio. Además, las dos cepas de Bdellovibrio presentaban diferencias basadas en el % de contenido de GC, la identidad de aminoácidos y la secuencia del gen 16S rRNA. La secuencia del gen 16S rRNA de Bdellovibrio sp. SKB1291214 compartía una identidad del 99% con la de un clon no cultivado de Bdellovibrio sp. 12L 106 (una distancia entre pares de 0,008) y una identidad del 95-97% (una distancia entre pares de 0,043) con la de otras cepas cultivables de Bdellovibrio spp. terrestres, incluida la cepa SSB218315. En Bdellovibrio sp. SKB1291214, se insertó una secuencia de 174 pb en la región del locus de interacción con el hospedador (hit) que suele atribuirse a la fijación de presas, la invasión y el desarrollo de fenotipos de Bdellovibrio independientes del hospedador. Además, un gen equivalente a Bd0108 en B. bacteriovorus HD100 no se conservó en Bdellovibrio sp. SKB1291214. Los resultados de este estudio proporcionaron información sobre las características genéticas y la diversidad del género Bdellovibrio que puede contribuir al éxito de sus aplicaciones como agente de biocontrol.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:SKB1291214, Bdellovibrio sp, Bdellovibrio spp, género Bdellovibrio, distancia entre pares, genes únicos, secuencia del gen ARNr 16S, otras especies terrestres cultivables de Bdellovibrio, B. bacteriovorus HD100, B. exovorus JJS
• Keywords:SKB1291214, Bdellovibrio sp, Bdellovibrio spp, genus Bdellovibrio, pairwise distance, unique genes, 16S rRNA gene sequence, other culturable terrestrial Bdellovibrio spp, B. bacteriovorus HD100, B. exovorus JJS