Las arqueas metanogénicas son un grupo de microorganismos estrictamente anaerobios caracterizados por su estricta dependencia del proceso de metanogénesis para la conservación de la energía. Entre las arqueas, también son el único grupo conocido que sintetiza proteínas que contienen selenocisteína o pirrolisina. Todas menos una de las proteínas arqueas conocidas que contienen pirrolisina y todas menos dos de las proteínas arqueas confirmadas que contienen selenocisteína están implicadas en la metanogénesis. La síntesis de estas proteínas procede a través de la supresión de los codones de parada traslacionales, pero por lo demás los dos sistemas son fundamentalmente diferentes. Este artículo destaca estas diferencias y resume los recientes avances en la investigación de las arqueas relacionada con la selenocisteína y la pirrolisina, y pretende situar estos conocimientos en el contexto de su singular metabolismo energético.
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