Resumen

Antecedentes. Se analizaron los perfiles de expresión génica de 181 muestras de cáncer de mama para identificar características pronósticas de los receptores nucleares NR5A1 y NR5A2 basadas en sus redes transcripcionales asociadas. Métodos. Se utilizó un enfoque de análisis de redes supervisado para construir la red de regulación transcripcional mediada por NR5A. Se utilizaron otras herramientas bioinformáticas y métodos estadísticos para confirmar y ampliar los resultados de la metodología de análisis de redes. Resultados. La expresión de NR5A2 es un factor negativo en el pronóstico del cáncer de mama tanto en cohortes mixtas ER(-) como ER(-)/ER( ). La importancia clínica y de cohorte de las actividades transcripcionales mediadas por NR5A2 indica que puede tener un papel significativo en la atenuación del desarrollo del grado y de las vías de transducción de señales relacionadas con el cáncer. La firma NR5A2 que condiciona un mal pronóstico se identificó a partir de los resultados de 15 sondas distintas. Alternativamente, la expresión de NR5A1 predice un pronóstico favorable cuando la expresión concurrente de NR5A2 es baja. También se identificó una firma favorable de ocho factores de transcripción mediados por NR5A1. Conclusiones. La correlación entre el mal pronóstico y la actividad de NR5A2 se identifica mediante la firma de 15 genes mediada por NR5A2. NR5A2 puede ser una diana farmacológica potencial para el tratamiento de un subconjunto de tumores de cáncer de mama en todos los subtipos de cáncer de mama, especialmente los tumores de mama ER(-). La característica de pronóstico favorable de NR5A1 se predice mediante la firma de 8 genes mediada por NR5A1.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:NR5A2, NR5A1, firma génica, mal pronóstico, enfoque de análisis de redes supervisado, perfiles de expresión génica, otras herramientas bioinformáticas, redes transcripcionales asociadas, pronóstico del cáncer de mama, muestras de cáncer de mama.
• Keywords:NR5A2, NR5A1, gene signature, poor prognosis, supervised network analysis approach, Gene expression profiles, Other bioinformatic tools, associated transcriptional networks, breast cancer prognosis, breast cancer samples