Resumen

Los sistemas hipersalinos cercanos a los niveles de saturación de sal representan un entorno extremo, en el que los organismos crecen y sobreviven cerca de los límites de la vida. Uno de los miembros abundantes de las comunidades microbianas de los sistemas hipersalinos es la arquea cuadrada Haloquadratum walsbyi. Utilizando un metagenoma de lectura corta del lago Tyrrell, un ecosistema hipersalino en Victoria, Australia, realizamos un análisis genómico comparativo de H. walsbyi para comprender mejor el grado de variación entre cepas/subespecies. Los resultados revelaron que las cepas/subespecies previamente aisladas no describen completamente el repertorio completo del paisaje genómico presente en H. walsbyi. Se observaron reajustes, inserciones y supresiones en los genomas de Haloquadratum derivados del lago Tyrrell y fueron apoyados por secuencias ambientales de novo, incluyendo cambios en el paisaje genómico dominante de las dos cepas más abundantes. Los análisis relativos a las halomucinas indicaron que los homólogos de esta gran proteína no son una característica común a todas las especies de Haloquadratum. Además, analizamos los transportadores de casetes de unión a ATP (transportadores de tipo ABC) en busca de evidencias de partición de nicho entre diferentes cepas/subespecies. Pudimos identificar subunidades transportadoras únicas y variables en los cinco genomas analizados y en las secuencias ambientales de novo, lo que sugiere que las diferencias en la adquisición de nutrientes y fuentes de carbono pueden desempeñar un papel en el mantenimiento de cepas/subespecies distintas.

• Materias:Células Enzimas Minería Minas y minería metanogénico Ecología
• Subjects:Cells Enzymes Mining Mines and mining methanogenic Ecology
• Palabras claves:subespecie, sistema hipersalino, lago tyrrell, análisis genómico comparativo, adquisición de fuentes de carbono, secuencia ambiental novo, paisaje genómico dominante, paisaje genómico presente, especies de haloquadratum, grado de variación
• Keywords:subspecies, hypersaline system, lake tyrrell, comparative genomic analysis, carbon source acquisition, novo environmental sequence, dominant genomic landscape, genomic landscape present, species of haloquadratum, extent of variation