Resumen

Las secuencias de tipificación polimórficas amplificadas (PATS), un sistema de tipificación de cepas de Escherichia coli O157:H7 (O157) basado en la PCR, tiene como objetivo las inserciones-deleciones y los polimorfismos de nucleótido único en los sitios de las enzimas de restricción XbaI y AvrII, respectivamente, y los genes de virulencia (stx1, stx2, eae, hlyA) en el genoma de O157. En este estudio se evaluó la capacidad del PATS para discriminar los aislados de O157 asociados al ganado vacuno. Una comparación en profundidad de 25 aislados bovinos de O157, procedentes de diferentes localizaciones geográficas del noroeste de Estados Unidos, mostró que alrededor del 85% de estos aislados compartían el mismo clado de dendogramas mediante PATS y electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), independientemente de los sitios de enzimas de restricción a los que se dirigieran. El coeficiente de correlación de Pearson, r, calculado en torno a 0,4, 0,3 y 0,4 para las similitudes basadas en XbaI, AvrII y enzimas combinadas PATS y PFGE, respectivamente, indica que estos perfiles compartían una correlación buena pero no alta, una inferencia esperada dado que las dos técnicas discriminan de forma diferente. Los aislados que se agrupaban de forma diferente se correspondían mejor con sus ubicaciones mediante PATS. En general, el PATS discriminó los aislados bovinos de O157 sin sesgos interpretativos ni software analítico sofisticado, y complementó eficazmente la PFGE sin duplicarla. Con su rápido tiempo de respuesta, PATS tiene un excelente potencial como herramienta conveniente para investigaciones epidemiológicas tempranas o de seguridad alimentaria, permitiendo una rápida notificación/implementación de medidas de cuarentena.

• Materias:Microbiología de alimentos Microbiología Bacteriología Micología Virulencia
• Subjects:Food microbiology Microbiology Bacteriology Mycology Virulence
• Palabras claves:PATS, sitios de enzimas de restricción AvrII, Escherichia coli O157, noroeste de Estados Unidos, aislados bovinos O157, diferentes ubicaciones geográficas, electroforesis en gel de campo, investigaciones sobre seguridad alimentaria, tiempo de respuesta rápido, sitios de enzimas de restricción.
• Keywords:PATS, AvrII restriction enzyme sites, Escherichia coli O157, Northwest United States, bovine O157 isolates, different geographic locations, field gel electrophoresis, food safety investigations, quick turnaround time, restriction enzyme sites