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Accurate Localization of the Integration Sites of Two Genomic Islands at Single-Nucleotide Resolution in the Genome of Bacillus cereus ATCC 10987Localización precisa de los sitios de integración de dos islas genómicas con resolución de un solo nucleótido en el genoma de Bacillus cereus ATCC 10987

Resumen

Hemos identificado dos islas genómicas, a saber, BCEGI-1 y BCEGI-2, en el genoma de Bacillus cereus ATCC 10987, basándonos en un análisis comparativo con Bacillus cereus ATCC 14579. Además, utilizando el perfil GC acumulativo y realizando búsquedas de homología entre los dos genomas, se determinaron los sitios de integración de las dos islas genómicas con una resolución de un solo nucleótido. BCEGI-1 se integra entre 159705 pb y 198000 pb, mientras que BCEGI-2 se integra entre el final del ORF BCE4594 y el inicio de la secuencia intergénica inmediatamente posterior a BCE4626, es decir, entre 4256803 pb y 4285534 pb. El BCEGI-1 alberga dos transposones bacterianos Tn7, que tienen dos conjuntos de genes que codifican TnsA, B, C y D. Generalmente se cree que, a diferencia de la vía TnsABC E, la vía TnsABC D sólo promovería la transmisión vertical a las células hijas. Sin embargo, las pruebas presentadas en este trabajo sugieren un papel de la vía TnsABC D en la transferencia horizontal de algunas islas genómicas.

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Información del documento

  • Titulo:Accurate Localization of the Integration Sites of Two Genomic Islands at Single-Nucleotide Resolution in the Genome of Bacillus cereus ATCC 10987
  • Autor:Ren, Zhang; Chun-Ting, Zhang
  • Tipo:Artículo
  • Año:2008
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácidos grasos Genoma Biología celular Genómica Ácido graso desaturasas
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