Resumen

Se llevó a cabo un estudio de asociación de genoma completo (GWAS) para examinar los loci de rasgos cuantitativos de expresión (eQTLs) para los genes de histonas. Se examinaron los eQTL comunes para múltiples genes de histonas en 373 líneas celulares linfoblastoides europeas (LCL). Se empleó un modelo de regresión lineal para identificar polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) asociados con la expresión de los genes histónicos, y el número de eQTLs se determinó mediante un análisis de desequilibrio de ligamiento. También se examinaron las asociaciones adicionales de los eQTLs identificados con otros genes. Identificamos 31 eQTLs para 29 genes de histonas a través de un análisis de genoma completo utilizando 29 genes de histonas (P<2.97×10-10). Entre ellos, 12 eQTLs se asociaron con la expresión de múltiples genes de histonas. El análisis de asociación de todo el transcriptoma utilizando los eQTLs identificados mostró sus asociaciones con 80 genes adicionales (P<4,75×10-6). En particular, la expresión de los genes RPPH1, SCARNA2 y SCARNA7 se asoció con 26, 25 y 23 eQTLs, respectivamente. Este estudio sugiere que los genes de histonas compartieron 12 eQTLs comunes que podrían regular la transcripción dependiente del ciclo celular de los genes de histonas y otros genes. Se necesitan más investigaciones para dilucidar los mecanismos transcripcionales de estos genes.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:genes histónicos, eQTLs, genes histónicos múltiples, expresión, eQTLs comunes, otros genes, líneas celulares linfoblastoides europeas, modelo de regresión lineal, análisis de desequilibrio de ligamiento, loci de rasgos cuantitativos
• Keywords:histone genes, eQTLs, multiple histone genes, expression, common eQTLs, other genes, European lymphoblastoid cell lines, linear regression model, linkage disequilibrium analysis, quantitative trait loci