Resumen

Cada vez hay más pruebas de que los microARN (miARN) desempeñan un papel importante en la respuesta inmunitaria contra agentes infecciosos, lo que sugiere que los miARN podrían ser explotables como firmas de exposición a agentes infecciosos específicos. Para identificar posibles biomarcadores de miARN tempranos de infecciones bacterianas, se expusieron células mononucleares de sangre periférica humana (hPBMC) a dos agentes selectos, Burkholderia pseudomallei K96243 y Francisella tularensis SHU S4, así como al control no patógeno Escherichia coli DH5α. Se recogieron muestras de ARN en tres momentos tempranos, 30, 60 y 120 minutos después de la exposición, y se secuenciaron. Los análisis de RNAseq identificaron 87 miRNAs expresados diferencialmente (DE) de forma lineal. De ellos, 31 miARN se analizaron mediante el ensayo miScript miRNA qPCR. Mediante la identificación por RNAseq y la validación por qPCR, identificamos especies de miRNA expresadas diferencialmente que pueden estar implicadas en la respuesta temprana a las infecciones bacterianas. Sobre la base de su regulación al alza en los primeros momentos tras la exposición en dos individuos diferentes, hsa-mir-30c-5p es una especie de miARN que podría estudiarse más a fondo como posible biomarcador de la exposición a estos patógenos intracelulares gramnegativos. Los análisis funcionales de ontología génica demostraron que la muerte celular programada es el proceso biológico de primer orden asociado a los miARN que están regulados al alza en las hPBMC expuestas a F. tularensis.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:puntos temporales tempranos, miARNs, infecciones bacterianas, Francisella tularensis SHU S4, control no patógeno Escherichia coli DH5α, Burkholderia pseudomallei K96243, sangre periférica humana, patógenos intracelulares negativos, muerte celular programada, agentes infecciosos específicos
• Keywords:early time points, miRNAs, bacterial infections, Francisella tularensis SHU S4, nonpathogenic control Escherichia coli DH5α, Burkholderia pseudomallei K96243, human peripheral blood, negative intracellular pathogens, programmed cell death, specific infectious agents