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The Shared and Specific Genes and a Comparative Genomics Analysis within Three Hanseniaspora StrainsLos genes compartidos y específicos y un análisis genómico comparativo dentro de tres cepas de Hanseniaspora

Resumen

Kloeckera apiculata desempeña un papel importante en la inhibición de las enfermedades del moho azul y verde en la poscosecha de los cítricos. Este estudio se basó en la secuenciación previa del genoma de la cepa 34-9 de K. apiculata. Tras la comparación homóloga, el andamiaje 27 se definió como la secuencia mitocondrial (mt) de K. apiculata 34-9. La comparación mostró un alto nivel de secuenciación de la mt. La comparación mostró un alto nivel de identidad de secuencia entre el andamio 27 y el ADNmt conocido de Hanseniaspora uvarum. La secuencia del genoma de H. vineae T02/19AF mostró varios fragmentos cortos y discontinuos homólogos al ADNmt de H. uvarum. Los genes compartidos y específicos de K. apiculata, H. uvarum y H. vineae se analizaron por familias utilizando la metodología TreeFam. Se utilizó el análisis GO para clasificar los genes compartidos y específicos. La mayoría de las familias de genes se clasificaron en las categorías funcionales de componente celular y procesos metabólicos. El filograma del genoma completo y el análisis de la sintenia genómica mostraron que K. apiculata estaba más estrechamente relacionada con H. uvarum que con H. vineae. Las comparaciones genómicas mostraron claramente las localizaciones de las regiones homólogas en cada genoma. Este análisis podría contribuir a descubrir las similitudes y diferencias genómicas dentro del género Hanseniaspora. Además, algunas regiones no coincidían de forma colineal en el genoma de K. apiculata en comparación con el de H. uvarum o H. vineae, y estas secuencias podrían ser el resultado de variaciones evolutivas.

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