Los organismos cambian para adaptarse al entorno en el que viven, evolucionando con individuos que se complementan. El darwinismo clásico postula la importancia primordial de las interacciones antagónicas y el egoísmo como motor principal de la evolución, promoviendo un aumento de las complejidades genómicas y del organismo. Recientemente, los avances en ecología evolutiva han reformulado esta noción, mostrando cómo la filtración de funciones biológicas favorece la reducción adaptativa del genoma, lo que conduce a la aparición de patrones de codependencia. Las comunidades microbianas son entidades complejas que ejercen una influencia gigantesca sobre el medio ambiente y la biología de los huéspedes eucariotas a los que se asocian. Sin embargo, aún estamos lejos de comprender los mecanismos ecológicos y evolutivos que rigen la dinámica comunitaria. Aquí revisamos las implicaciones de la racionalización del genoma en el despliegue de la codependencia dentro de las comunidades microbianas y cómo esto se traduce en una comprensión de los patrones ecológicos subyacentes a las propiedades emergentes de la comunidad.
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