Las plantas no deben ser consideradas como entidades por sí mismas, sino como la parte visible de complejos planta-microbio que se entienden mejor como holobiomas. Algunos microorganismos, cuando se les da la oportunidad de habitar las raíces de las plantas, se convierten en simbiontes de las raíces. Esta colonización de las raíces por microbios simbióticos puede aumentar los rendimientos de los cultivos al promover el crecimiento tanto de los brotes como de las raíces, al mejorar la absorción, fijación y/o uso más eficiente de los nutrientes, al mejorar la resistencia de las plantas a plagas, enfermedades y tensiones abióticas que incluyen la sequía, la salinidad y otras condiciones ambientales, y al aumentar la capacidad de las plantas para la fotosíntesis. Nos referimos a las asociaciones planta-microbio con estas capacidades que han sido establecidas intencionalmente como holobiomas de plantas mejorados (EPHs). Aquí, consideramos cuatro grupos de endófitos simbióticos filogenét
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