Resumen

Las alteraciones de la regulación transcripcional son un factor importante en el cáncer de mama. Los ARN no codificantes, como los microARN (miR), desempeñan funciones muy influyentes en la regulación transcripcional de los genes. La regulación transcripcional puede modelarse y analizarse con éxito utilizando la teoría de redes complejas. En particular, las interacciones entre dos clases distintas de elementos biológicos, como los miR y los genes, pueden abordarse mediante el formalismo de redes bipartitas. Basándose en las propiedades de las redes bipartitas, es posible identificar miR muy influyentes en la red, como los que tienen un gran número de conexiones que indican la regulación de un gran conjunto de genes. Algunos miRs de una red son no redundantes, lo que indica que son los únicos responsables de la regulación de un determinado conjunto de genes, que a su vez pueden estar asociados a un proceso biológico concreto. Nuestra hipótesis es que los miRs altamente influyentes y no redundantes, que denominamos Commodore miRs (Cdre-miRs), tienen un papel importante en el control de funciones biológicas a través de redes transcripcionales. En este trabajo, analizamos la regulación de la expresión génica por miRs en tejido mamario sano y canceroso utilizando redes bipartitas miR-gen inferidas a partir de los datos de expresión del Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA). Observamos diferencias en las distribuciones de grado, coeficiente de agrupamiento y redundancia para miRs y genes en la red, lo que indica diferencias en la forma en que estos elementos interactúan entre sí. Además, identificamos un pequeño conjunto de cinco Cdre-miRs en la red del cáncer de mama: miR-190b, miR-let7i, miR-292-b, miR-511, y miR-141. El vecindario de genes controlados por cada uno de estos miRs está implicado en funciones biológicas concretas, como los procesos asociados a la estructura de la dineína, la respuesta inmunitaria, la angiogénesis, la actividad de las citocinas y la motilidad celular. Proponemos que estos Cdre-miRs son importantes elementos de control de funciones biológicas desreguladas en el cáncer de mama.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:miRs, genes, Cdre, miR, red, regulación, funciones biológicas, cáncer de mama, regulación transcripcional, Atlas del Genoma del Cáncer
• Keywords:miRs, genes, Cdre, miR, network, regulation, biological functions, breast cancer, transcriptional regulation, Cancer Genome Atlas