Resumen

La tuberculosis es una de las enfermedades infecciosas más mortíferas del mundo. En Mycobacterium tuberculosis, los cambios en la expresión génica son muy variables e implican a muchos genes, por lo que el cribado tradicional de un único gen diana de M. tuberculosis no ha podido satisfacer las necesidades del diagnóstico clínico. En este estudio, utilizando los conjuntos de datos GEO del National Center for Biotechnology Information (NCBI), se obtuvieron datos de perfiles de expresión génica de sangre total en pacientes con tuberculosis pulmonar activa. Se aplicaron estadísticas bayesianas de modelo lineal-experiencia utilizando el paquete Limma en R combinado con pruebas t para el filtrado no específico de los datos del perfil de expresión, y se determinaron los genes humanos expresados diferencialmente. Utilizando DAVID y KEGG, se realizó el análisis funcional de los genes expresados diferencialmente (análisis GO) y el análisis de las vías de señalización. A partir de los genes expresados diferencialmente, se integraron las bases de datos de elementos reguladores transcripcionales (TRED) para construir la red reguladora de genes patógenos de M. tuberculosis, y se analizó la correlación de los genes de la red con la enfermedad con la herramienta de anotación en línea DAVID. Se predijo que IL-6, JUN y TP53, junto con los factores de transcripción SRC, TNF y MAPK14, podrían regular la respuesta inmunitaria, siendo su función la actividad de la región extracelular y la unión a proteínas durante la infección por M. tuberculosis.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:M. tuberculosis, bases de datos de elementos reguladores transcripcionales, datos de perfiles de expresión génica en sangre total, dianas de M. tuberculosis, tuberculosis pulmonar activa, enfermedades infecciosas más mortíferas, datos de perfiles de expresión, actividad de regiones extracelulares, herramienta de anotación en línea, factores de transcripción SRC
• Keywords:M. tuberculosis, transcriptional regulatory element databases, whole blood gene expression profile data, M. tuberculosis targets, active pulmonary tuberculosis, deadliest infectious diseases, expression profile data, extracellular region activity, online annotation tool, transcription factors SRC