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La endosimbiosis es un tipo de simbiosis en el que una especie de escala microscópica habita la célula de otra especie de una escala más grande, de modo que el intercambio de subproductos metabólicos produce un beneficio mutuo. Estos beneficios pueden ocurrir en diferentes niveles biológicos. Por ejemplo, la endosimbiosis promueve la eficiencia del metabolismo celular, la replicación celular y la generación de una capa macroscópica que protege al organismo de sus depredadores. Por lo tanto, modelar la endosimbiosis requiere un enfoque de sistemas complejos y multilevel. Proponemos un modelo de endosimbiosis basado en redes de reacciones, donde las especies de la red de reacciones representan especies ecológicas, recursos o condiciones para que ocurran las interacciones ecológicas, y los mecanismos de interacción endosimbiótica se representan mediante diferentes secuencias de reacciones (procesos) en la red de reacciones. Como ejemplo, desarrollamos un modelo simplificado de la interacción
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