Resumen

Con el desarrollo continuo de la tecnología de secuenciación, la cantidad de datos bioinformáticos ha aumentado geométricamente, y la cantidad masiva de datos bioinformáticos plantea requisitos más estrictos para los problemas de ensamblaje de secuencias. El algoritmo de ensamblaje de secuencias basado en la estrategia DBG (De Bruijn graph) es un algoritmo clave en bioinformática, ampliamente utilizado en el ámbito del ensamblaje de secuencias de genes. La investigación actual en el ámbito del ensamblaje de secuencias siempre se centra en la optimización de pasos específicos para un algoritmo concreto y carece de investigación sobre marcos de algoritmos de alto nivel de abstracción a nivel de dominio. Hasta cierto punto, esto conduce a la redundancia del algoritmo de ensamblaje de secuencias, y algunos problemas pueden ser causados por el algoritmo de selección artificial. Este artículo analiza el dominio de DBGSA y establece un modelo de características de este dominio. Basándose en el método de programación de la producción, se diseña interactivamente el componente del algoritmo DBGSA. Con el apoyo de la plataforma PAR, se implementa formalmente la biblioteca de componentes del algoritmo DBGSA y, además, se utiliza la biblioteca de componentes DBGSA para ensamblar el algoritmo específico. Esta investigación añade la investigación a nivel de dominio al dominio del ensamblaje de secuencias e implementa la biblioteca de componentes DBGSA, que puede ensamblar algoritmos específicos de ensamblaje de secuencias, garantizando la eficiencia del desarrollo de algoritmos y la fiabilidad de los algoritmos de generación de ensamblaje. Al mismo tiempo, también proporciona una valiosa referencia para resolver problemas en el ámbito del ensamblaje de secuencias.

• Materias:Insuficiencia cardíaca Plataforma de servicios Filtro de orden óptimo Características clínicas Osteoporosis
• Subjects:Heart failure Platform services Optimal order filtering Clinical features Osteoporosis
• Palabras claves:dominio, biblioteca de componentes DBGSA, algoritmo de ensamblaje de secuencias, ensamblaje de secuencias, datos bioinformáticos, algoritmo específico, biblioteca de componentes de algoritmos DBGSA, algoritmos específicos de ensamblaje de secuencias, componente de algoritmos DBGSA, grafo de De Bruijn
• Keywords:domain, DBGSA component library, sequence assembly algorithm, sequence assembly, bioinformatics data, specific algorithm, DBGSA algorithm component library, specific sequence assembly algorithms, DBGSA algorithm component, De Bruijn graph