Resumen

Las proteínas de la apoptosis desempeñan un papel importante en el mecanismo de la muerte celular programada. La predicción de la localización subcelular de las proteínas de la apoptosis es un paso esencial para comprender sus funciones e identificar las dianas farmacológicas. Se han desarrollado muchos métodos de predicción computacional para la localización subcelular de las proteínas de la apoptosis. Sin embargo, estos trabajos existentes sólo se centran en las proteínas que tienen una única localización; las proteínas con múltiples localizaciones no se tienen en cuenta o se asume que no existen al construir los modelos de predicción, por lo que no pueden predecir completamente todas las localizaciones de las proteínas de la apoptosis con múltiples localizaciones. Para abordar este problema, este trabajo propone un nuevo predictor multietiqueta denominado MultiP-Apo, que puede predecir no sólo las proteínas de apoptosis con una única localización subcelular, sino también aquellas con múltiples localizaciones subcelulares. En concreto, dada una proteína de consulta, se utiliza el método de extracción de características basado en GO para extraer su vector de características. Posteriormente, el vector de características GO es clasificado por un nuevo clasificador multietiqueta basado en las características específicas de la etiqueta. Se trata del primer predictor multietiqueta establecido para identificar las localizaciones subcelulares de las proteínas de apoptosis multilocalizadas. Como estudio inicial, MultiP-Apo alcanza una precisión global de 58,49 y jackknife test, lo que indica que nuestro predictor propuesto puede convertirse en una herramienta de alto rendimiento muy útil en esta área.

• Materias:Algoritmos genéticos Cerebro - fisiopatología Neurociencia Cognitiva Fisiología vegetal
• Subjects:Genetic algorithms Brain - pathophysiology Cognitive Neuroscience Plant physiology
• Palabras claves:proteína de la apoptosis, localización subcelular, localización múltiple, localización de la apoptosis, vector de características go, muerte celular programada, novedoso predictor multietiqueta, métodos de extracción de características, localización subcelular múltiple, proteína de la apoptosis multilocalización
• Keywords:apoptosis protein, subcellular localization, multiple location, localization of apoptosis, go features vector, programmed cell death, novel multilabel predictor, features extraction methods, multiple subcellular location, multilocation apoptosis protein