Resumen

La evaluación de la resistencia a los fármacos antituberculosos se realiza de forma rutinaria con métodos genotípicos o fenotípicos; sin embargo, pueden observarse discordancias entre estas diferentes metodologías. Nuestro objetivo fue identificar mutaciones que pudieran explicar resultados discordantes en la evaluación de susceptibilidad a rifampicina e isoniazida entre métodos moleculares y fenotípicos, utilizando secuenciación del genoma completo (WGS). Se seleccionaron cepas peruanas que mostraban resultados sensibles en la prueba GenoType MTBDRplus v2.0 y resistentes en las proporciones en la prueba de agar-placa para isoniazida o rifampicina. Se confirmó la discordancia repitiendo ambas pruebas y se realizó WGS, utilizando la metodología Next Generation Sequencing. Las secuencias obtenidas se alinearon "por referencia" (mapeo genómico) mediante el programa BWA con el algoritmo "mem", utilizando como referencia el genoma de la cepa M. tuberculosis H37Rv. Se confirmó la discordancia en 14 cepas para la rifampicina y 21 para la isoniazida, con 1 cepa en común para ambos antibióticos, para un total de 34 cepas únicas. La mutación más frecuente en el gen rpoB en las cepas discordantes para la rifampicina fue V170F. Las mutaciones más frecuentes en las cepas discordantes para la isoniazida fueron katG R463L, kasA G269S y Rv1592c I322V. Se han notificado otras mutaciones. Este es el primer estudio en Latinoamérica que aborda las mutaciones presentes en cepas con resultados discordantes entre los métodos genotípico y fenotípico a rifampicina e isoniazida. Estas mutaciones podrían ser consideradas como futuros blancos potenciales de las pruebas genotípicas para la evaluación de la susceptibilidad a estos fármacos.

• Materias:Microbiología de alimentos Microbiología Bacteriología Propiedades farmacológicas Virología
• Subjects:Food microbiology Microbiology Bacteriology Pharmacological Properties Virology
• Palabras claves:isoniazida, métodos fenotípicos, rifampicina, mutaciones, resultados discordantes, cepas discordantes, prueba GenoType MTBDRplus v2.0, cepa M. tuberculosis H37Rv, metodología de secuenciación de próxima generación, Varias otras mutaciones.
• Keywords:isoniazid, phenotypic methods, rifampicin, mutations, discordant results, discordant strains, GenoType MTBDRplus v2.0 test, M. tuberculosis H37Rv strain, Next Generation Sequencing methodology, Several other mutations