Para determinar la relevancia biológica de dos proteínas de S. acidocaldarius en la reparación de fotoproductos UV, se interrumpieron los genes correspondientes (Saci_1227 y Saci_1096) y se examinaron los fenotipos de los mutantes resultantes mediante diversos ensayos genéticos. La disrupción utilizó la integración por recombinación homóloga de un gen pyrE funcional pero heterólogo, promovida por secuencias cortas unidas a ambos extremos mediante PCR. Los análisis fenotípicos de los disruptores confirmaron que el ORF Saci_1227 codifica una fotoliasa de ADN que funciona in vivo, pero no pudieron implicar al ORF Saci_1096 en la reparación de daños en el ADN inducidos por la radiación UV u otros factores externos, a pesar de su similitud con los genes que codifican endonucleasas de daños por la radiación UV. El éxito de la estrategia de interrupción del gen, que utilizó extensiones 5′ de los cebadores de PCR para dirigir la integración del casete, sugiere ventajas potenciales para la construcción rutinaria de cepas de Sulfolobus.
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