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NDDN: A Cloud-Based Neuroinformation Database for Developing Neuronal NetworksNDDN: una base de datos de neuroinformación basada en la nube para desarrollar redes neuronales

Resumen

La actividad eléctrica de las redes neuronales disociadas en desarrollo es de inmensa importancia para comprender las propiedades generales del procesamiento y almacenamiento de la información neuronal. Además, la complejidad y diversidad de los patrones de actividad de las redes las convierten en candidatas ideales para desarrollar nuevos modelos computacionales y evaluar algoritmos. Sin embargo, son escasas las bases de datos que se centran en la dinámica cambiante de las redes durante su desarrollo. Aquí describimos el diseño y la implementación de la Base de Datos de Neuroinformación para Redes en Desarrollo (NDDN), un repositorio de datos electrofisiológicos recogidos de redes de hipocampo cultivadas a largo plazo. La NDDN contiene más de 15 terabytes de datos de matrices multielectrodo consistentes en 25.380 elementos recogidos de 105 lotes de cultivo. Los metadatos, incluida la información de cultivo y registro y los protocolos de estimulación/aplicación de fármacos, están vinculados a cada elemento de datos. La NDDN también incluye una caja de herramientas Matlab llamada MEAKit para facilitar el análisis de los datos descargados. Esperamos que la NDDN contribuya a los campos de la neurociencia experimental y computacional.

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