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Selective Phenome Growth Adapted Model: A Novel Landscape to Represent Aptamer Ligand BindingModelo de Crecimiento Fenotípico Selectivo Adaptado: Un Nuevo Paisaje para Representar la Unión de Ligandos Aptámeros.

Resumen

Los aptámeros son oligonucleótidos de cadena sencilla seleccionados mediante enfoques evolutivos a partir de bibliotecas masivas con un potencial significativo para el reconocimiento molecular específico en diagnósticos y terapéutica. Una caracterización empírica completa de un experimento de selección de aptámeros no es factible debido a la vasta complejidad de la selección de aptámeros. La simulación de la selección de aptámeros se ha utilizado para caracterizar y optimizar el proceso de selección; sin embargo, la ausencia de un buen modelo para la unión aptámero-objetivo limita este campo de estudio. Aquí, generamos paisajes teóricos de aptitud que parecen representar de manera más precisa la unión aptámero-objetivo. El método utilizado para generar estos paisajes, crecimiento selectivo del fenoma, es un nuevo enfoque en el que los contribuyentes fenotípicos se añaden secuencialmente a un mapa de interacción genotipo/fenotipo de tal manera que se aumenta la aptitud de una secuencia

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