Resumen

Este estudio tiene como objetivo el desarrollo del portal oncoNcRNA para explorar el potencial oncogénico del RNA no codificante (ncRNAs) a partir de una base de datos que comprende información a gran escala de alteraciones en el número de copias somáticas (SCNA) en cáncer humano. El portal consiste en la integración a gran escala de datos de SCNA públicos y proporciona la información de SCNA de todos los ncRNA bien anotados en hasta 64 tipos de cáncer humano. Esto permite a los investigadores analizar de manera rápida e intuitiva el potencial oncogénico de los ncRNAs de interés, de hecho, fue descubierto un gran número de ncRNAs que son amplificados o eliminados con frecuencia dentro y entre los diferentes tipos de tumores. Adicionalmente, los autore proporcionan una herramienta de correlación para explorar la relación entre expresión génica y el número de copias de alrededor de 10000 muestras tumorales en 36 tipos de cáncer identificados por The Cancer Genome Atlas (TCGA).

• Materias:Tecnología de la información Programación (Computadores electrónicos) Desarrollo de programas para computador Biología molecular
• Subjects:Information technology Programming (Electronic computer) Development of computer programs Molecular biology
• Palabras claves:ncRNAs, Cáncer, Alteración número de copias somáticas, Biomarcador
• Keywords:ncRNAs, Cancer, Somatic copy number alteration, Biomarker