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Artículo

Highly Variable Genomic Landscape of Endogenous Retroviruses in the C57BL/6J Inbred Strain, Depending on Individual Mouse, Gender, Organ Type, and Organ LocationPaisaje Genómico Altamente Variable de Retrovirus Endógenos en la Cepa C57BL/6J, Dependiendo del Ratón, Género, Tipo de Órgano y Localización del Órgano

Resumen

Los elementos repetitivos transponibles, denominados "TREoma", representan aproximadamente el 40% del genoma del ratón. Postulamos que el genoma de la línea germinal experimenta una diversificación temporal y espacial en genomas somáticos en conjunción con la actividad TREome. Los ratones consanguíneos C57BL/6J fueron sometidos a análisis del paisaje genómico utilizando una sonda TREome de retrovirus endógenos del tipo del virus de la leucemia murina (MLV-ERVs). Ninguno compartía el mismo paisaje MLV-ERV dentro de cada grupo de comparación: (1) esperma y 18 tejidos de un ratón, (2) seis compartimentos cerebrales de dos hembras, (3) muestras de bazo y timo de cuatro grupos de edad, (4) tres conjuntos de tejidos espaciales de dos hembras, y (5) muestras de riñón e hígado de tres hembras y tres machos. Curiosamente, los machos tenían más copias genómicas MLV-ERV que las hembras; además, sólo en los machos, los riñones tenían más copias MLV-ERV que los hígados. Tal vez, los paisajes MLV-ERV dependientes del ratón, el sexo y el tejido/la célula estén relacionados con los fenotipos específicos individuales y dinámicos de la población endogámica C57BL/6J.

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