Las plataformas de secuenciación de nueva generación y los ensayos de genotipado de alto rendimiento han acelerado notablemente el ritmo de desarrollo de herramientas genómicas y recursos para varios cultivos. Complementando los avances tecnológicos, también se han observado cambios conceptuales en el diseño de poblaciones experimentales. La disponibilidad de poblaciones de mapeo de segunda generación que abarcan múltiples alelos, múltiples rasgos y extensos eventos de recombinación está cambiando radicalmente el fenómeno del mapeo clásico de QTL. Además, los enfoques crecientes de mejoramiento molecular como la selección recurrente asistida por marcadores (MARS) que son capaces de aprovechar varios QTL son de particular importancia para obtener un genotipo diseñado que lleve las combinaciones más deseables de alelos favorables. Además, la rápida generación de datos de marcadores en todo el genoma junto con el fácil acceso a pantallas fenotípicas precisas y exactas permiten la explotación a gran escala de LD no solo para descubrir
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