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Protein Coding Gene Nucleotide Substitution Pattern in the Apicomplexan Protozoa Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominisPatrón de sustitución nucleotídica de genes codificadores de proteínas en los protozoos apicomplejos Cryptosporidium parvum y Cryptosporidium hominis

Resumen

Cryptosporidium parvum y C. hominis son protozoos patógenos relacionados que infectan el epitelio intestinal de humanos y otros vertebrados. Para explorar la evolución de estos parásitos e identificar genes sometidos a selección positiva, realizamos una comparación de todo el genoma por pares entre todos los genes codificantes de proteínas ortólogos de C. parvum y C. hominis. Para detectar el impacto de la selección positiva y purificadora, se calculó en todo el genoma la proporción de sustituciones de nucleótidos no sinónimas frente a las sinónimas (dN/dS). De 2465 pares de genes ortólogos, un total de 27 (1,1%) mostraron una elevada proporción de sustituciones no sinónimas, lo que concuerda con una selección positiva. La mayoría de estos genes fueron anotados como proteínas hipotéticas. Además, las proteínas con dominios transmembrana y péptido señal son significativamente más frecuentes en el grupo de alto dN/dS.

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Información del documento

  • Titulo:Protein Coding Gene Nucleotide Substitution Pattern in the Apicomplexan Protozoa Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis
  • Autor:Guangtao, Ge; Lenore, Cowen; Xiaochuan, Feng; Giovanni, Widmer
  • Tipo:Artículo
  • Año:2008
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácidos grasos Genoma Biología celular Genómica Ácido graso desaturasas
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