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Global Expression Patterns of Three Festuca Species Exposed to Different Doses of Glyphosate Using the Affymetrix GeneChip Wheat Genome ArrayPatrones de Expresión Global de Tres Especies de Festuca Expuestas a Diferentes Dosis de Glifosato Utilizando el Affymetrix GeneChip Wheat Genome Array

Resumen

Se ha demostrado que el glifosato actúa como inhibidor de una vía biosintética de aminoácidos aromáticos, pero se desconocen otras vías que puedan verse afectadas por el glifosato. Las hibridaciones entre especies pueden proporcionar una herramienta para dilucidar vías biológicas conservadas entre organismos. Los análisis comparativos del genoma han indicado un alto nivel de colinealidad entre las especies de gramíneas y Festuca, en la que nos centramos aquí, y mostraron reordenamientos comunes a la familia Pooideae. Basándonos en la conservación de secuencias entre especies de gramíneas, seleccionamos la matriz Affymetrix GeneChip Wheat Genome Array como herramienta para el análisis de los perfiles de expresión de tres especies de Festuca (festuca) con tolerancias claramente diferentes a distintos niveles de glifosato. Se registraron diferencias en la expresión de transcritos tras la aplicación foliar de glifosato a 1,58 mM y 6,32 mM, que representan el 5 y 20%, respectivamente, de la dosis recomendada. Las diferencias pusieron de relieve categorías de procesos metabólicos generales, como la fotosíntesis, la síntesis de proteínas y las respuestas al estrés, y un mayor número de transcritos respondieron a la aplicación de un 20% de glifosato. La expresión diferencial de genes que codifican proteínas implicadas en la vía del ácido shikímico no pudo identificarse mediante hibridación cruzada. Los datos de microarrays se confirmaron mediante análisis de RT-PCR y qRT-PCR. Este es el primer informe que analiza el potencial de la hibridación cruzada en especies de festuca y los datos y análisis ayudarán a ampliar nuestros conocimientos sobre los procesos celulares afectados por el glifosato.

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