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mRNA/microRNA Profile at the Metamorphic Stage of Olive Flounder (Paralichthys olivaceus)Perfil de ARNm/microARN en el estadio metamórfico de la platija olivácea (Paralichthys olivaceus)

Resumen

Los peces planos son famosos por su transformación asimétrica durante la metamorfosis. El mecanismo molecular que subyace al desarrollo asimétrico se ha especulado durante más de un siglo y aún no se conoce bien. Hasta la fecha, no se ha identificado ningún gen relacionado con la metamorfosis en los peces planos. Como primer paso para la detección de genes relacionados con la metamorfosis, en este estudio construimos una biblioteca de ADNc de cuerpo entero y una biblioteca de miARN de cuerpo entero e identificamos 1051 EST únicos, 23 miARN únicos y 4 snoARN en Paralichthys olivaceus premetamorfoseado y prometamorfoseado. 1005 de las EST eran nuevas, lo que sugiere que existe un perfil especial de expresión génica en la fase metamórfica. Cuatro miARN (pol-miR-20c, pol-miR-23c, pol-miR-130d y pol-miR-181e) eran nuevos para P. olivaceus; se caracterizaban por ser homologías muy conservadas de miARN publicados pero con al menos un nucleótido de diferencia. Se cuantificaron 24 mRNAs y 23 miRNAs representativos durante la metamorfosis de P. olivaceus utilizando RT PCR cuantitativa o qRT PCR de bucle de tallo. Nuestros resultados mostraron que 20 de los mRNAs podrían estar asociados con eventos metamórficos tempranos, 10 de los mRNAs podrían estar relacionados con eventos metamórficos tardíos, y 16 de los miRNAs podrían estar involucrados en la regulación de la metamorfosis. Los datos proporcionados en este estudio serían útiles para seguir identificando genes relacionados con la metamorfosis en P. olivaceus.

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Información del documento

  • Titulo:mRNA/microRNA Profile at the Metamorphic Stage of Olive Flounder (Paralichthys olivaceus)
  • Autor:Caixia, Xie; Shanliang, Xu; Linlin, Yang; Zhonghe, Ke; Jubin, Xing; Junwei, Gai; Xiaoling, Gong; Liuxiong, Xu; Baolong, Bao
  • Tipo:Artículo
  • Año:2011
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Genes Genética Molecular Ácido ribonucleico (ARN) Genoma Proteómica
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