Resumen

La reciente ventaja obtenida por la secuenciación de nueva generación permite investigar en profundidad un nuevo "viejo" tipo de transcrito no codificante, los ARN circulares. Los ARN circulares son ARN no traducidos, típicamente no poliadenilados, con una resistencia a las exonucleasas que les confiere la capacidad de ser más estables que las isoformas comunes de ARN lineal. Utilizamos una herramienta de detección bioinformática (CIRCexplorer) para investigar los circARN predictivos a partir de los datos secuenciados de nueva generación de cinco muestras de carcinoma ductal in situ (CDIS) y carcinoma ductal invasivo (CDI) adyacente emparejado. Además, también investigamos los ARN circulares expresados en MCF7, una línea celular de carcinoma ductal de mama invasivo. Describimos el contexto genómico de los ARN circulares predichos y abordamos los posibles papeles funcionales hipotéticos. Este estudio mostró una perspectiva de un panel de circRNAs predictivos identificados y la función que podrían ejercer los circRNAs.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:ARN circulares, circARN predictivos, carcinoma ductal invasivo adyacente, isoformas lineales comunes de ARN, línea celular de carcinoma ductal, posibles papeles funcionales hipotéticos, herramienta bioinformática de detección, secuenciación de nueva generación, ARN circulares, investigación en profundidad.
• Keywords:circular RNAs, predictive circRNAs, adjacent invasive ductal carcinoma, common linear RNA isoforms, ductal carcinoma cell line, hypothetical possible functional roles, bioinformatic detection tool, next generation sequencing, Circular RNAs, depth investigation